error - Cómo escribir trycatch en R

try catch r

Question

Quiero escribir el código trycatch para lidiar con el error en la descarga desde la web.

url <- c(
    "http://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/base/html/connections.html",
    "http://en.wikipedia.org/wiki/Xz")
y <- mapply(readLines, con=url)

Estas dos declaraciones se ejecutan con éxito. A continuación, creo una dirección web inexistente:

url <- c("xxxxx", "http://en.wikipedia.org/wiki/Xz")

url[1] no existe. ¿Cómo se escribe un bucle trycatch (función) para que:

1. Cuando la URL es incorrecta, la salida será: "la URL de la web es incorrecta, no se puede obtener".
2. Cuando la URL es incorrecta, el código no se detiene, ¿pero continúa descargándose hasta el final de la lista de URL?

Answer 1

Aquí va un ejemplo sencillo :

# Do something, or tell me why it failed
my_update_function <- function(x){
    tryCatch(
        # This is what I want to do.
        # If executing more than one expression you need curly braces.
        {
        y = x * 2
        return(y)
        },
        # ... but if an error occurs, tell me what happened: 
        error=function(error_message) {
            message("My message is here!")
            message("And below is the error message from R:")
            message(error_message)
            return(NA)
        }
    )
}

Si también desea capturar una "advertencia", simplemente agregue warning= similar a la parte error= .

Answer 2

Como acabo de perder dos días de mi vida tratando de resolver para tryCatch para una función irr, pensé que debía compartir mi sabiduría (y lo que falta). FYI - irr es una función real de FinCal en este caso donde se obtuvieron errores en algunos casos en un conjunto de datos grande.

1. Configurar tryCatch como parte de una función. Por ejemplo:

   irr2 <- function (x) {
     out <- tryCatch(irr(x), error = function(e) NULL)
     return(out)
   }

2. Para que el error (o advertencia) funcione, realmente necesita crear una función. Originalmente, para la parte de error, simplemente escribí error = return(NULL) y TODOS los valores regresaron nulos.

3. Recuerde crear una subproducción (como mi "salida") y return(out) .

Answer 3

Pues bien: bienvenido al mundo R ;-)

Aqui tienes

Configurando el codigo

urls <- c(
    "http://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/base/html/connections.html",
    "http://en.wikipedia.org/wiki/Xz",
    "xxxxx"
)
readUrl <- function(url) {
    out <- tryCatch(
        {
            # Just to highlight: if you want to use more than one 
            # R expression in the "try" part then you''ll have to 
            # use curly brackets.
            # ''tryCatch()'' will return the last evaluated expression 
            # in case the "try" part was completed successfully

            message("This is the ''try'' part")

            readLines(con=url, warn=FALSE) 
            # The return value of `readLines()` is the actual value 
            # that will be returned in case there is no condition 
            # (e.g. warning or error). 
            # You don''t need to state the return value via `return()` as code 
            # in the "try" part is not wrapped insided a function (unlike that
            # for the condition handlers for warnings and error below)
        },
        error=function(cond) {
            message(paste("URL does not seem to exist:", url))
            message("Here''s the original error message:")
            message(cond)
            # Choose a return value in case of error
            return(NA)
        },
        warning=function(cond) {
            message(paste("URL caused a warning:", url))
            message("Here''s the original warning message:")
            message(cond)
            # Choose a return value in case of warning
            return(NULL)
        },
        finally={
        # NOTE:
        # Here goes everything that should be executed at the end,
        # regardless of success or error.
        # If you want more than one expression to be executed, then you 
        # need to wrap them in curly brackets ({...}); otherwise you could
        # just have written ''finally=<expression>'' 
            message(paste("Processed URL:", url))
            message("Some other message at the end")
        }
    )    
    return(out)
}

Aplicando el codigo

> y <- lapply(urls, readUrl)
Processed URL: http://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/base/html/connections.html
Some other message at the end
Processed URL: http://en.wikipedia.org/wiki/Xz
Some other message at the end
URL does not seem to exist: xxxxx
Here''s the original error message:
cannot open the connection
Processed URL: xxxxx
Some other message at the end
Warning message:
In file(con, "r") : cannot open file ''xxxxx'': No such file or directory

Investigando la salida

> head(y[[1]])
[1] "<!DOCTYPE html PUBLIC /"-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN/">"      
[2] "<html><head><title>R: Functions to Manipulate Connections</title>"      
[3] "<meta http-equiv=/"Content-Type/" content=/"text/html; charset=utf-8/">"
[4] "<link rel=/"stylesheet/" type=/"text/css/" href=/"R.css/">"             
[5] "</head><body>"                                                          
[6] ""    

> length(y)
[1] 3

> y[[3]]
[1] NA

Observaciones adicionales

trata de atraparlo

tryCatch devuelve el valor asociado a la ejecución de expr menos que haya un error o una advertencia. En este caso, se pueden especificar valores de retorno específicos (consulte el return(NA) arriba) proporcionando una función de controlador respectiva (consulte los argumentos error y warning en ?tryCatch ). Estas pueden ser funciones que ya existen, pero también puede definirlas dentro de tryCatch() (como lo hice anteriormente).

Las implicaciones de elegir valores de retorno específicos de las funciones del controlador

Como hemos especificado que NA debe devolverse en caso de error, el tercer elemento en y es NA . Si hubiéramos elegido NULL para ser el valor de retorno, la longitud de y solo habría sido 2 lugar de 3 ya que lapply() simplemente "ignorará" los valores de retorno que son NULL . También tenga en cuenta que si no especifica un valor de retorno explícito a través de return() , las funciones del controlador devolverán NULL (es decir, en caso de un error o una condición de advertencia).

Mensaje de advertencia "no deseado"

Como warn=FALSE no parece tener ningún efecto, una forma alternativa de suprimir la advertencia (que en este caso no es realmente interesante) es usar

suppressWarnings(readLines(con=url))

en lugar de

readLines(con=url, warn=FALSE)

Expresiones multiples

Tenga en cuenta que también puede colocar varias expresiones en la "parte de expresiones reales" (argumento expr de tryCatch() ) si las envuelve entre corchetes (como lo tryCatch() parte tryCatch() ).

Answer 4

R usa funciones para implementar el bloque try-catch:

La sintaxis se parece a esto:

result = tryCatch({
    expr
}, warning = function(warning_condition) {
    warning-handler-code
}, error = function(error_condition) {
    error-handler-code
}, finally={
    cleanup-code
})

En tryCatch () hay dos "condiciones" que pueden manejarse: "advertencias" y "errores". Lo importante a entender al escribir cada bloque de código es el estado de ejecución y el alcance. @source