ggplot - ¿Cómo(y por qué) usas contrastes?

r plot legend

Question

¿Bajo qué casos crea contrastes en su análisis? ¿Cómo se hace y para qué se usa?

Comprobé ?contrasts y ?C - ambos conducen al "Capítulo 2 de los Modelos estadísticos en S", que no está disponible para mí.

Answer 1

Eche un vistazo here (páginas 365-370, que son gratis para ver). En la página 364 comienza un análisis de varianza de una vía de un experimento de competencia de planta. El código de la página 364 que falta es:

comp<-read.table("c://temp//competition.txt",header=T)
attach(comp)
names(comp)
[1] "biomass" "clipping"
The categorical explanatory variable is clipping and it has five levels as follows:
levels(clipping)
...

La definición de contrastes aparece más adelante, en la página 368 (en el párrafo homónimo). Si desea seguir los ejemplos, puede descargar los conjuntos de datos. Ver mi publicación aquí .

Está fuera de discusión que el libro es muy recomendable.

Answer 2

Los contrastes son necesarios cuando se ajustan los modelos lineales con factores (es decir, variables categóricas) como variables explicativas. El contraste especifica cómo se codificarán los niveles de los factores en una familia de variables ficticias numéricas para ajustar el modelo.

Aquí hay algunas buenas notas para las diferentes variedades de contrastes utilizados: http://www.unc.edu/courses/2006spring/ecol/145/001/docs/lectures/lecture26.htm

Cuando los contrastes utilizados cambian, el modelo permanece igual en términos de las distribuciones de probabilidad conjuntas subyacentes permitidas. Solo su parametrización cambia. Los valores ajustados siguen siendo los mismos también. Además, una vez que tiene el valor de los parámetros para una elección de contrastes, es fácil deducir cuál habría sido el valor de los parámetros para otra elección de contrastes.

Por lo tanto, la elección de los contrastes no tiene consecuencias estadísticas. Se trata simplemente de hacer que los coeficientes y las pruebas de hipótesis sean más fáciles de interpretar.