example - Renombrar archivos múltiples con un bucle bash

bash script example

Question

Necesito cambiar el nombre de 45 archivos, y no quiero hacerlo uno por uno. Estos son los nombres de archivo:

chr10.fasta         chr13_random.fasta  chr17.fasta         chr1.fasta          chr22_random.fasta  chr4_random.fasta  chr7_random.fasta  chrX.fasta
chr10_random.fasta  chr14.fasta         chr17_random.fasta  chr1_random.fasta   chr2.fasta          chr5.fasta         chr8.fasta         chrX_random.fasta
chr11.fasta         chr15.fasta         chr18.fasta         chr20.fasta         chr2_random.fasta   chr5_random.fasta  chr8_random.fasta  chrY.fasta
chr11_random.fasta  chr15_random.fasta  chr18_random.fasta  chr21.fasta         chr3.fasta          chr6.fasta         chr9.fasta         
chr12.fasta         chr16.fasta         chr19.fasta         chr21_random.fasta  chr3_random.fasta   chr6_random.fasta  chr9_random.fasta
chr13.fasta         chr16_random.fasta  chr19_random.fasta  chr22.fasta         chr4.fasta          chr7.fasta         chrM.fasta

Necesito cambiar la extensión ".fasta" a ".fa". Estoy tratando de escribir un script bash para hacerlo:

for i in $(ls chr*)

do

NEWNAME = `echo $i | sed ''s/sta//g''`

mv $i $NEWNAME

done

Pero no funciona. ¿Puedes decirme por qué o dar otra solución rápida?

¡Gracias!

Answer 1

Si tiene el comando de rename , puede hacer:

rename .fasta .fa chr*.fasta

Answer 2

for f in chr*.fasta; do mv "$f" "${f/%.fasta/.fa}"; done

Answer 3

Varios errores aquí:

• NEWNAME = debería estar sin espacio. Aquí bash busca un comando llamado NEWNAME y falla.
• usted analiza la salida de ls. esto es malo si tienes archivos con espacios. Bash puede compilar una lista de archivos con el operador glob * .
• No se escapa de "$i" y "$NEWNAME" . Si alguno de ellos contiene un espacio, hace dos argumentos para mv.
• Si un nombre de archivo comienza con un guión, mv creerá que se trata de un cambio. Usar -- para detener el procesamiento de argumentos.

Tratar:

for i in chr*
do
  mv -- "$i" "${i/%.fasta/.fa}"
done

o

for i in chr*
do
  NEWNAME="${i/%.fasta/.fa}"
  mv -- "$i" "$NEWNAME"
done

El "%{var/%pat/replacement} " busca solo pat al final de la variable y la reemplaza con replacement .