example - Renombrar archivos múltiples con un bucle bash

bash script example

Question

Necesito cambiar el nombre de 45 archivos, y no quiero hacerlo uno por uno. Estos son los nombres de archivo:

chr10.fasta chr13_random.fasta chr17.fasta chr1.fasta chr22_random.fasta chr4_random.fasta chr7_random.fasta chrX.fasta
chr10_random.fasta chr14.fasta chr17_random.fasta chr1_random.fasta chr2.fasta chr5.fasta chr8.fasta chrX_random.fasta
chr11.fasta chr15.fasta chr18.fasta chr20.fasta chr2_random.fasta chr5_random.fasta chr8_random.fasta chrY.fasta
chr11_random.fasta chr15_random.fasta chr18_random.fasta chr21.fasta chr3.fasta chr6.fasta chr9.fasta
chr12.fasta chr16.fasta chr19.fasta chr21_random.fasta chr3_random.fasta chr6_random.fasta chr9_random.fasta
chr13.fasta chr16_random.fasta chr19_random.fasta chr22.fasta chr4.fasta chr7.fasta chrM.fasta

Necesito cambiar la extensión ".fasta" a ".fa". Estoy tratando de escribir un script bash para hacerlo:

for i in $(ls chr*)
do
NEWNAME = `echo $i | sed ''s/sta//g''`
mv $i $NEWNAME
done

Pero no funciona. ¿Puedes decirme por qué o dar otra solución rápida?

¡Gracias!

Answer 1

Si tiene el comando de rename , puede hacer:

rename .fasta .fa chr*.fasta

Answer 2

for f in chr*.fasta; do mv "$f" "${f/%.fasta/.fa}"; done

Answer 3

Varios errores aquí:

• NEWNAME = debería estar sin espacio. Aquí bash busca un comando llamado NEWNAME y falla.
• usted analiza la salida de ls. esto es malo si tienes archivos con espacios. Bash puede compilar una lista de archivos con el operador glob * .
• No se escapa de "$i" y "$NEWNAME" . Si alguno de ellos contiene un espacio, hace dos argumentos para mv.
• Si un nombre de archivo comienza con un guión, mv creerá que se trata de un cambio. Usar -- para detener el procesamiento de argumentos.

Tratar:

for i in chr*
do
mv -- "$i" "${i/%.fasta/.fa}"
done

o

for i in chr*
do
NEWNAME="${i/%.fasta/.fa}"
mv -- "$i" "$NEWNAME"
done

El "%{var/%pat/replacement} " busca solo pat al final de la variable y la reemplaza con replacement .