motor - ¿Hay un paquete para mapeo objeto-relacional en R?

orm framework

Question

(Por mapeo objeto-relacional, me refiero a lo que se describe aquí: Wikipedia: Mapeo objeto-relacional ).

Aquí es cómo podría imaginarme este trabajo en R: un tipo de "marco de datos virtual" está vinculado a una base de datos y devuelve los resultados de las consultas SQL cuando se accede. Por ejemplo, head(virtual_list) realmente devolvería los resultados de (select * from mapped_table limit 5) en la base de datos asignada.

He encontrado este post por John Myles White , pero parece que no ha habido progreso en los últimos 3 años.

¿Hay un paquete de trabajo que implementa esto?

Si no,

1. ¿Sería útil?
2. ¿Cuál sería la mejor manera de implementarlo (S4?)?

Answer 1

Como usuario experimentado de R, no usaría esto. En primer lugar, este ''marco virtual'' sería lento de usar, ya que constantemente necesita sincronizar entre la memoria R y la base de datos. También requeriría el bloqueo de la tabla de la base de datos, ya que de lo contrario tiene resultados impredecibles debido a que otras ediciones suceden al mismo tiempo.

Finalmente, no creo que R sea adecuado para implementar una evaluación diferente de los objetos de promise . Al hacer myFrame$foo[ myFrame$foo > 40 ] todavía se obtendrá la columna foo completa, ya que no es posible implementar un esquema de traducción completo de R a SQL.

Por lo tanto, prefiero cargar un dataframe () de una consulta, usarlo y volver a escribirlo en la base de datos si es necesario.

Answer 2

El paquete muy reciente dplyr está implementando esto (entre otras características sorprendentes).

Aquí hay ilustraciones de los ejemplos de la función src_mysql() :

# Connection basics ---------------------------------------------------------
# To connect to a database first create a src:
my_db <- src_mysql(host = "blah.com", user = "hadley",
  password = "pass")
# Then reference a tbl within that src
my_tbl <- tbl(my_db, "my_table")

# Methods -------------------------------------------------------------------
batting <- tbl(lahman_mysql(), "Batting")
dim(batting)
colnames(batting)
head(batting)

Answer 3

Hay un viejo paquete no compatible, SQLiteDF , que hace eso. Constrúyalo desde la fuente e ignore los numerosos mensajes de error.

> # from example(sqlite.data.frame)
>
> library(SQLiteDF)
> iris.sdf <- sqlite.data.frame(iris)
> iris.sdf$Petal.Length[1:10] # $ done via SQL
 [1] 1.4 1.4 1.3 1.5 1.4 1.7 1.4 1.5 1.4 1.5

Answer 4

Junto a los diversos paquetes de controladores para consultar DBs (DBI, RODBC, RJDBC, RMySql, ...) y dplyr, también hay sqldf https://cran.r-project.org/web/packages/sqldf/

Esto importará automáticamente los marcos de datos en la base de datos y le permitirá consultar los datos a través de SQL. Al final se borra la db.

Answer 5

No creo que sea útil. R no es un lenguaje OOP real. La estructura de datos "central" en R es el marco de datos. No es necesario realizar asignaciones relacionales de objetos aquí. Lo que usted desea es una asignación entre las tablas de SQL y los marcos de datos, y RMySQL y RODBC proporcionan precisamente eso:

dbGetQuery para devolver los resultados de una consulta en un marco de datos y dbWriteTable para insertar datos en una tabla o realizar una actualización masiva (desde un marco de datos).

Answer 6

Parece que John Myles White se ha dado por vencido.

Hay un poco de una solución explicada here .