python - recorrer - arrojando valores infinitos desde dataframes en pandas?

recorrer data frame pandas

Question

¿Cuál es la forma más rápida / simple de eliminar los valores de nan e inf / -inf de un DataFrame de pandas sin restablecer el mode.use_inf_as_null ? Me gustaría poder usar el subset y how argumentos de dropna , excepto con valores inf considerados como faltantes, como:

df.dropna(subset=["col1", "col2"], how="all", with_inf=True)

¿es posible? ¿Hay alguna manera de decirle a dropna que incluya inf en su definición de valores perdidos?

Answer 1

Aquí hay otro método que usa .loc para reemplazar inf con nan en una serie:

s.loc[(~np.isfinite(s)) & s.notnull()] = np.nan

Entonces, en respuesta a la pregunta original:

df = pd.DataFrame(np.ones((3, 3)), columns=list(''ABC''))

for i in range(3): 
    df.iat[i, i] = np.inf

df
          A         B         C
0       inf  1.000000  1.000000
1  1.000000       inf  1.000000
2  1.000000  1.000000       inf

df.sum()
A    inf
B    inf
C    inf
dtype: float64

df.apply(lambda s: s[np.isfinite(s)].dropna()).sum()
A    2
B    2
C    2
dtype: float64

Answer 2

Con contexto de opción, esto es posible sin establecer permanentemente use_inf_as_null . Por ejemplo:

with pd.option_context(''mode.use_inf_as_null'', True):
    df = df.dropna(subset=[''col1'', ''col2''], how=''all'')

Por supuesto, se puede configurar para tratar inf como NaN permanentemente con pd.set_option(''use_inf_as_null'', True) también.

Answer 3

La forma más simple sería replace primero infs a NaN:

df.replace([np.inf, -np.inf], np.nan)

y luego usa el dropna :

df.replace([np.inf, -np.inf], np.nan).dropna(subset=["col1", "col2"], how="all")

Por ejemplo:

In [11]: df = pd.DataFrame([1, 2, np.inf, -np.inf])

In [12]: df.replace([np.inf, -np.inf], np.nan)
Out[12]:
    0
0   1
1   2
2 NaN
3 NaN

El mismo método funcionaría para una serie.

Answer 4

La solución anterior modificará las inf s que no están en las columnas de destino. Para remediar eso,

lst = [np.inf, -np.inf]
to_replace = dict((v, lst) for v in [''col1'', ''col2''])
df.replace(to_replace, np.nan)

Answer 5

Otra solución más sería usar el método isin . Úselo para determinar si cada valor es infinito o falta y luego encadene all método para determinar si todos los valores en las filas son infinitos o faltan.

Finalmente, use la negación de ese resultado para seleccionar las filas que no tienen todos los valores infinitos o perdidos a través de la indexación booleana.

all_inf_or_nan = df.isin([np.inf, -np.inf, np.nan]).all(axis=''columns'')
df[~all_inf_or_nan]