error cannot allocate r memory-leaks rdcomclient

cannot - memory r



Fuga de memoria al abrir el marco de datos con RDCOMClient (0)

Estoy experimentando con el uso del paquete RDCOMClient para abrir un marco de datos sobre la marcha en Excel. Tengo un código funcional que abrirá un marco de datos en Excel, sin embargo, el problema al que me estoy enfrentando es que rsession.exe no está liberando los recursos de la memoria al cargar los datos en Excel cuando se completa el código. Incluso después de cerrar la aplicación de Excel, los recursos de la memoria no se liberan. ¿Hay algo que me falta, que podría utilizar para liberar la memoria de rsession.exe? La única forma en que he podido liberar la memoria es cerrando RStudio y abriéndolo de nuevo.

Código para la función

in.xl <- function(data, headers = TRUE, rownames = FALSE) { require(RDCOMClient) # Attempt to coerce non dataframe data into a dataframe if (!is.data.frame(data)) { data <- as.data.frame(data) } # Set row range for data if (headers == TRUE) { d.row.start <- 2 d.row.end <- nrow(data) + 1 } else { d.row.start <- 1 d.row.end <- nrow(data) } # Set column range for data if (rownames == TRUE) { d.col.start <- 2 d.col.end <- ncol(data) + 1 } else { d.col.start <- 1 d.col.end <- ncol(data) } # Create COM Connection to Excel xlApp <- COMCreate("Excel.Application") xlWB <- xlApp[["Workbooks"]]$Add() xlSheet <- xlWB$Sheets(1) # Check if headers should be included if (headers == TRUE) { # Create a dataframe from headers headers <- t(as.data.frame(colnames(data))) # Set range for header values startCell <- xlSheet$Cells(1, d.col.start) endCell <- xlSheet$Cells(1, d.col.end) rng <- xlSheet$Range(startCell, endCell) # Add headers to Excel sheet rng[["Value"]] <- asCOMArray(headers) # Remove header dataframe rm(headers) } # Check if rownames should be included if(rownames == TRUE) { # Create dataframe from row names if (is.null(rownames(data))) { rnames = as.data.frame(1:nrow(data)) } else { rnames = as.data.frame(rownames(data)) } # Set range for row name values startCell <- xlSheet$Cells(d.row.start, 1) endCell <- xlSheet$Cells(d.row.end, 1) rng <- xlSheet$Range(startCell, endCell) # Add row names to Excel sheet rng[["Value"]] <- asCOMArray(rnames) # Remove row name dataframe rm(rnames) } xlApp[["ScreenUpdating"]] <- FALSE nblocks <- ceiling(nrow(data) / 2000) pb <- txtProgressBar(min = 0, max = nblocks, initial = 0, style = 3, width = 20) data.start <- d.row.start block <- 1 d.row.end <- d.row.start df.row.start <- 1 while(d.row.end < nrow(data)) { d.row.end <- d.row.start + 1999 df.row.end <- df.row.start + 1999 if (d.row.end > nrow(data) + data.start) { d.row.end <- nrow(data) + data.start - 1 } if (df.row.end > nrow(data)) { df.row.end <- nrow(data) } xlApp[["StatusBar"]] <- paste("Processing block", block, "of", nblocks) # Set range for data values rng <- xlSheet$Range(xlSheet$Cells(d.row.start, d.col.start), xlSheet$Cells(d.row.end, d.col.end)) # Add data to Excel sheet rng[["Value"]] <- asCOMArray(data[df.row.start:df.row.end, ]) d.row.start <- d.row.end + 1 df.row.start <- df.row.end + 1 if (block != nblocks) { block <- block + 1 } # update the progress bar with the current value setTxtProgressBar(pb,block) rm(rng, vals) gc() } xlApp[["StatusBar"]] <- "Formatting Columns..." # Auto adjust column widths for(c in 1:d.col.end) { col <- xlSheet$Columns(c) col[["EntireColumn"]]$AutoFit() } xlApp[["StatusBar"]] <- "" xlApp[["ScreenUpdating"]] <- TRUE # Show Excel application xlApp[["Visible"]] <- TRUE gc() }

Código para generar un gran marco de datos para la prueba. (Hace que sea más fácil ver el problema de uso de memoria cuando se mira el proceso rsession.exe en el Administrador de tareas)

df <- data.frame(replicate(20, sample(replicate(10, paste(sample(LETTERS, 15, rep = TRUE), collapse = "")), 100000, rep = TRUE))) in.xl(df)