numpy.savetxt que da como resultado un error de falta de coincidencia de formato en Python 3.5

formatting python-3.5

Question

Estoy tratando de guardar una matriz numpy (Nx3, float64) en un archivo txt usando numpy.savetxt:

np.savetxt(f, mat, fmt=''%.5f'', delimiter='' '')

Esta línea funcionó en Python 2.7, pero en Python 3.5, obtengo el siguiente error:

TypeError: no coincidencia entre el tipo de matriz (''float64'') y el especificador de formato (''% .5f% .5f% .5f'')

Cuando estoy ingresando en el código de savetxt, la impresión del error (traceback.format_exc ()) en el bloque catch (numpy.lib.npyio, línea 1158), el error es completamente diferente:

TypeError: el argumento write () debe ser str, no bytes

La línea de código resultante de la excepción es la siguiente:

fh.write(asbytes(format % tuple(row) + newline))

Intenté eliminar los asbytes, y parece solucionar este error. ¿Es un error en numpy?

Answer 1

savetxt abre el archivo en modo wb y, por lo tanto, escribe todo como bytes.

Si en cambio abro el archivo con ''w'', recibo su segundo error:

In [403]: x=np.ones((3,3),dtype=np.float64)
In [404]: with open(''test.txt'',''w'') as f:
np.savetxt(f,x,fmt=''%.5f'')
.....:
TypeError: must be str, not bytes

Pero no hay problema con

In [405]: with open(''test.txt'',''wb'') as f:
np.savetxt(f,x,fmt=''%.5f'')
.....:
In [406]: cat test.txt
1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000

Esto está en Py3.4; No tengo el numpy instalado con mi 3.5 Python. Pero no esperaría una diferencia.

Hace

''%.5f''%1.2342

¿Trabaja en su sistema? También puedes probar

''%.5f %.5f %.5f''%tuple(mat[0,:])