serie - calculando la diferencia de tiempo en R

series de tiempo multivariadas en r

Question

Tengo una información con más de 3 millones de registros que tienen start.time y end.time como dos de las variables. Los primeros 10 obses son los siguientes:

 start.date start.time end.date end.time
1 2012-07-13 15:01:32 2012-07-13 15:02:42
2 2012-07-05 18:26:31 2012-07-05 18:27:19
3 2012-07-14 20:23:21 2012-07-14 20:24:11
4 2012-07-29 16:09:54 2012-07-29 16:10:48
5 2012-07-21 14:58:32 2012-07-21 15:00:17
6 2012-07-04 15:36:31 2012-07-04 15:37:11
7 2012-07-22 18:28:31 2012-07-22 18:28:50
8 2012-07-09 21:08:42 2012-07-09 21:09:02
9 2012-07-05 09:44:52 2012-07-05 09:45:05
10 2012-07-02 18:50:47 2012-07-02 18:51:38

Necesito calcular la diferencia entre start.time y end.time.

Use el siguiente código:

mbehave11$diff.time <- difftime(mbehave11$end.time, mbehave11$start.time, units="secs")

Pero estoy recibiendo este error:

Error in as.POSIXlt.character(x, tz, ...) :
character string is not in a standard unambiguous format
In addition: Warning messages:
1: In is.na.POSIXlt(strptime(xx, f <- "%Y-%m-%d %H:%M:%OS", tz = tz)) :
Reached total allocation of 1535Mb: see help(memory.size)

Answer 1

Debe convertir sus cadenas en objetos de fecha antes de poder hacer aritmética de fecha / hora. Prueba esto:

a) Leyendo tus datos:

R> dat <- read.table(textConnection("start.date start.time end.date end.time
2012-07-13 15:01:32 2012-07-13 15:02:42
2012-07-05 18:26:31 2012-07-05 18:27:19
2012-07-14 20:23:21 2012-07-14 20:24:11"), header=TRUE) 

b) Trabajando en una observación:

 R> strptime( paste(dat[,1], dat[,2]), "%Y-%m-%d %H:%M:%S")
[1] "2012-07-13 15:01:32" "2012-07-05 18:26:31" "2012-07-14 20:23:21" 

c) Trabajando en el set, convirtiendo a numérico:

 R> as.numeric(difftime(strptime(paste(dat[,1],dat[,2]),"%Y-%m-%d %H:%M:%S"),
strptime(paste(dat[,3],dat[,4]),"%Y-%m-%d %H:%M:%S")))
[1] -70 -48 -50
R>