para - r paquetes instalados

¿Por qué el paquete plyr no usa mi back-end paralelo?

Question

Estoy tratando de usar el paquete parallel en R para operaciones paralelas en lugar de doSNOW ya que está integrado y aparentemente de la manera en que el proyecto R quiere que las cosas vayan. Estoy haciendo algo mal que no puedo precisar sin embargo. Toma por ejemplo esto:

a <- rnorm(50)
b <- rnorm(50)

arr <- matrix(cbind(a,b),nrow=50)

aaply(arr,.margin=1,function(x){x[1]+x[2]},.parallel=F)

Esto funciona bien, produciendo las sumas de mis dos columnas. Pero si trato de traer el paquete paralelo:

library(parallel)
nodes <- detectCores()
cl <- makeCluster(nodes)
setDefaultCluster(cl)

aaply(arr,.margin=1,function(x){x[1]+x[2]},.parallel=T)

Lanza el error

2: In setup_parallel() : No parallel backend registered
3: executing %dopar% sequentially: no parallel backend registered 

¿Estoy inicializando el backend mal?

Answer 1

La documentación para estados aaply

.parallel: si es ''VERDADERO'', aplique la función en paralelo, usando un back-end paralelo provisto por foreach

así que presumiblemente necesita usar el paquete foreach lugar del paquete parallel .

Answer 2

Prueba esta configuración:

library(doParallel)
library(plyr)

nodes <- detectCores()
cl <- makeCluster(nodes)
registerDoParallel(cl)

aaply(ozone, 1, mean,.parallel=TRUE)

stopCluster(cl)

Como nunca utilicé plyr para computación paralela, no tengo idea de por qué esto plyr advertencias. El resultado es correcto de todos modos.