apps - Shiny R Zip múltiples PDFS para descargar

embedding shiny apps in r markdown documents

Question

Lo siento si esto es demasiado simple ... Necesito comprimir un número de archivos PDF generados para descargar. Traté de usar la función Zip , pero fallé con el error:

Warning: running command ''"zip" -r9X "pdfs.zip" "plot_1.pdf" "plot_2.pdf" "plot_3.pdf" "plot_4.pdf" "plot_5.pdf" '' had status 127
Error opening file: 2
Error reading: 6

A continuación se muestra mi código y cualquier sugerencia es bienvenida (basada en la aplicación brillante: desactivar botón de descarga ):

UI.R

library(shiny)

shinyUI(fluidPage(
  singleton(tags$head(HTML(
''
  <script type="text/javascript">
    $(document).ready(function() {
      // disable download at startup. data_file is the id of the downloadButton
      $("#data_file").attr("disabled", "true").attr("onclick", "return false;");

      Shiny.addCustomMessageHandler("download_ready", function(message) {
        $("#data_file").removeAttr("disabled").removeAttr("onclick").html(
          "<i class=//"fa fa-download//"></i>Download " + message.fileSize + " ");
      });
    })
  </script>
''
))),
  tabsetPanel(
    tabPanel(''Data download example'',
      actionButton("start_proc", h5("Click to start processing data")),
      hr(),

      downloadButton("data_file"),
      helpText("Download will be available once the processing is completed.")
    )
  )
))

UI.R del servidor

library(shiny)

get_a_pdf_plot <- function(my_i){
      pdf(paste("plot_", my_i, sep=""))
      plot(1:my_i*5, 1:my_i*5,
           xlim = c(1, my_i*5),
           ylim = c(1, my_i*5),
           main = paste("1:", my_i, sep = ""))
      dev.off()
}


shinyServer(function(input, output, session) {

  observe({
    if (input$start_proc > 0) {
      Sys.sleep(2)
      session$sendCustomMessage("download_ready", list(fileSize= "Ready"))
    }
  })

  output$data_file <- downloadHandler(
       filename = ''pdfs.zip'',
       content = function(fname) {
        fs <- c()
        tmpdir <- tempdir()
        setwd(tempdir())
        print (tempdir())

        for (i in c(1,2,3,4,5)) {
          path <- paste("plot_", i, ".pdf", sep="")
          fs <- c(fs, path)
          get_a_pdf_plot(i)
        }
        print (fs)
        zip(zipfile="pdfs.zip", files=fs)
       }
  )
})

Answer 1

En get_a_pdf_plot ha omitido el .pdf

get_a_pdf_plot <- function(my_i){
  pdf(paste("plot_", my_i,".pdf", sep=""))
  plot(1:my_i*5, 1:my_i*5,
       xlim = c(1, my_i*5),
       ylim = c(1, my_i*5),
       main = paste("1:", my_i, sep = ""))
  dev.off()
}

En su downloadHandler su necesidad de indicar brillante en el tipo de descarga:

 output$data_file <- downloadHandler(
    filename = ''pdfs.zip'',
    content = function(fname) {
      fs <- c()
      tmpdir <- tempdir()
      setwd(tempdir())
      print (tempdir())

      for (i in c(1,2,3,4,5)) {
        path <- paste("plot_", i, ".pdf", sep="")
        fs <- c(fs, path)
        get_a_pdf_plot(i)
      }
      print (fs)
      zip(zipfile="pdfs.zip", files=fs)
    },
    contentType = "application/zip"
  )

Answer 2

Esta idea me ayudó a configurar la exportación . Se ejecuta fuera de la caja en una Mac. Windows requiere descargar Rtools y señalar el zip en Rtools ( de esta pregunta ). No he tenido problemas todavía.

Sys.setenv(R_CMDZIP = ''C:/Rtools/bin/zip'')

La documentación de " ?zip " menciona "En Windows, el valor predeterminado depende de un programa zip (por ejemplo, el de Rtools". Si apunta a un archivo comprimido ejecutable para su programa zip favorito, estoy seguro de que funcionará de manera similar (si no lo hace) quiero descargar Rtools).