traza - Multiplicar filas de matriz por vector?
sustituir na por 0 en r (3)
En realidad, el sweep no es la opción más rápida en mi computadora:
MyMatrix <- matrix(c(1:1e6), ncol=1e4, byrow=TRUE)
MyVector <- c(1:1e4)
Rprof(tmp <- tempfile(),interval = 0.001)
t(t(MyMatrix) * MyVector) # first option
Rprof()
MyTimerTranspose=summaryRprof(tmp)$sampling.time
unlink(tmp)
Rprof(tmp <- tempfile(),interval = 0.001)
MyMatrix %*% diag(MyVector) # second option
Rprof()
MyTimerDiag=summaryRprof(tmp)$sampling.time
unlink(tmp)
Rprof(tmp <- tempfile(),interval = 0.001)
sweep(MyMatrix ,MARGIN=2,MyVector,`*`) # third option
Rprof()
MyTimerSweep=summaryRprof(tmp)$sampling.time
unlink(tmp)
Rprof(tmp <- tempfile(),interval = 0.001)
t(t(MyMatrix) * MyVector) # first option again, to check order
Rprof()
MyTimerTransposeAgain=summaryRprof(tmp)$sampling.time
unlink(tmp)
MyTimerTranspose
MyTimerDiag
MyTimerSweep
MyTimerTransposeAgain
Esto produce:
> MyTimerTranspose
[1] 0.04
> MyTimerDiag
[1] 40.722
> MyTimerSweep
[1] 33.774
> MyTimerTransposeAgain
[1] 0.043
Además de ser la opción más lenta, la segunda opción alcanza el límite de memoria (2046 MB). Sin embargo, considerando las opciones restantes, la doble transposición parece mucho mejor que el sweep en mi opinión.
Editar
Intentando datos más pequeños una cantidad repetida de veces:
MyMatrix <- matrix(c(1:1e3), ncol=1e1, byrow=TRUE)
MyVector <- c(1:1e1)
n=100000
[...]
for(i in 1:n){
# your option
}
[...]
> MyTimerTranspose
[1] 5.383
> MyTimerDiag
[1] 6.404
> MyTimerSweep
[1] 12.843
> MyTimerTransposeAgain
[1] 5.428
Estoy optimizando una función y quiero deshacerme de la lentitud de los bucles. Estoy buscando una forma más rápida de multiplicar cada fila de una matriz por un vector.
¿Algunas ideas?
EDITAR:
No estoy buscando una multiplicación ''clásica''.
P.ej. Tengo una matriz que tiene 23 columnas y 25 filas y un vector que tiene una longitud de 23. En un resultado quiero tener la matriz 25x23 que tiene cada fila multiplicada por el vector.
Creo que estás buscando sweep() .
> (mat <- matrix(rep(1:3,each=5),nrow=3,ncol=5,byrow=TRUE))
[,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,] 1 1 1 1 1
[2,] 2 2 2 2 2
[3,] 3 3 3 3 3
> vec <- 1:5
> sweep(mat,MARGIN=2,vec,`*`)
[,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,] 1 2 3 4 5
[2,] 2 4 6 8 10
[3,] 3 6 9 12 15
Ha sido una de las principales funciones de R, aunque se han realizado mejoras en ella a lo largo de los años.
> MyMatrix <- matrix(c(1,2,3, 11,12,13), nrow = 2, ncol=3, byrow=TRUE)
> MyMatrix
[,1] [,2] [,3]
[1,] 1 2 3
[2,] 11 12 13
> MyVector <- c(1:3)
> MyVector
[1] 1 2 3
Puedes usar cualquiera de los siguientes:
> t(t(MyMatrix) * MyVector)
[,1] [,2] [,3]
[1,] 1 4 9
[2,] 11 24 39
o:
> MyMatrix %*% diag(MyVector)
[,1] [,2] [,3]
[1,] 1 4 9
[2,] 11 24 39