xml - instalador - No se puede instalar el paquete R en Ubuntu 11.04

sudo r studio

Question

Soy nuevo en Linux y R.

Instalé R 2.12 en Ubuntu 11.04. Hoy traté de instalar un nuevo paquete, así que ejecuté el siguiente comando:

install.packages(''XML'')

Pero la instalación falló y dio la siguiente información:

* installing *source* package ‘XML’ ...
checking for gcc... gcc
checking for C compiler default output file name... a.out
checking whether the C compiler works... yes
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of executables...
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc accepts -g... yes
checking for gcc option to accept ISO C89... none needed
checking how to run the C preprocessor... gcc -E
No ability to remove finalizers on externalptr objects in this verison of R
checking for sed... /bin/sed
checking for pkg-config... /usr/bin/pkg-config
checking for xml2-config... no
Cannot find xml2-config
ERROR: configuration failed for package ‘XML’
* removing ‘/home/spirit/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.12/XML’
The downloaded packages are in
‘/tmp/RtmpoZYxnv/downloaded_packages’
Warning message:
In install.packages("XML") :
installation of package ''XML'' had non-zero exit status

También probé:

sudo install.packages(''XML'')

Pero da la misma información de error.

¿Alguien puede darme algún consejo? Gracias por adelantado.

Answer 1

La respuesta de Colin es correcta en un sentido estricto, pero al mismo tiempo errónea, como puedes decir

 sudo apt-get install r-cran-xml

como XML es uno de los paquetes CRAN disponibles en Ubuntu. Hacer apt-cache search r-cran-* ver los demás.

Answer 2

El método install.packages

Necesita instalar el paquete ubuntu libxml2-dev De modo que en el indicador de shell escriba:

sudo apt-get update
sudo apt-get install libxml2-dev

Necesitará poderes de sudo especiales para esto.

Método de paquete de Ubuntu

Como Richie y Dirk mencionaron, también puedes usar:

sudo apt-get install r-cran-xml

Si sigues este camino, te recomendaría que revises la página de fuentes R ubuntu, que te garantizará que tienes una versión actual de R y los paquetes R asociados. Esto podría ser importante si está utilizando la versión LTS de ubuntu.