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Cita de "estadísticas" de R para un artículo científico

Question

Analicé mis datos usando el paquete R ''stats'' (versión 2.15.3). Un revisor me preguntó la cita correcta de este paquete y no solo el común

R Core Team (2012). R: Un lenguaje y entorno para la informática estadística. R Foundation for Statistical Computing, Viena, Austria. ISBN 3-900051-07-0, URL http://www.R-project.org/

¿Alguien sabe dónde puedo encontrar una cita válida para insertar en mi artículo? Gracias

Answer 1

Ahora hay un paquete grateful que puede ser útil:

El objetivo de agradecer es hacer que sea muy fácil citar los paquetes R utilizados en cualquier informe o publicación. Al llamar a una única función, escaneará el proyecto en busca de paquetes R utilizados y generará un documento con citas en el formato de salida deseado (Word, PDF, HTML, Markdown). Es importante destacar que estas referencias se pueden formatear para una revista específica, de modo que podamos simplemente pegarlas directamente en la lista de bibliografía de nuestro manuscrito o informe.

https://github.com/Pakillo/grateful

Si se cargan las stats del paquete, la referencia se puede obtener ejecutando:

library(grateful)
cite_packages()

-Assuming grateful ya se ha instalado ejecutando:

library(devtools)
install_github("Pakillo/grateful")

Answer 2

Como señaló , una función para crear una lista de referencias de solo paquetes cargados sería útil. Como él solo nos mostró un ejemplo y no la función, escribí uno que uso muy a menudo en análisis científicos y documentos (a veces combinados con R Markdown).

citations <- function(includeURL = TRUE, includeRStudio = TRUE) {
    if(includeRStudio == TRUE) {
        ref.rstudio <- RStudio.Version()$citation
        if(includeURL == FALSE) {
            ref.rstudio$url = NULL;
        }
        print(ref.rstudio, style = ''text'')
        cat(''/n'')
    }

    cit.list <- c(''base'', names(sessionInfo()$otherPkgs))
    for(i in 1:length(cit.list)) {
        ref <- citation(cit.list[i])
        if(includeURL == FALSE) {
            ref$url = NULL;
        }
        print(ref, style = ''text'')
        cat(''/n'')
    }
}

Entonces, por ejemplo, después de ejecutar

library(readr)
library(dplyr)
library(ggplot2)
library(knitr)

las citations() función citations() se imprimirán:

Equipo RStudio (2016). RStudio: Entorno de desarrollo integrado para R. RStudio, Inc., Boston, MA. http://www.rstudio.com .

R Core Team (2017). R: Un lenguaje y entorno para la informática estadística . R Foundation for Statistical Computing, Viena, Austria. https://www.R-project.org .

Xie Y (2016). knitr: Un paquete de propósito general para generación dinámica de informes en R. Paquete R versión 1.15.1, http://yihui.name/knitr .

Xie Y (2015). Documentos dinámicos con R y knitr , 2da edición. Chapman y Hall / CRC, Boca Raton, Florida. ISBN 978-1498716963, http://yihui.name/knitr .

Xie Y (2014). "Knitr: una herramienta completa para la investigación reproducible en R." En Stodden V, Leisch F y Peng RD (eds.), La implementación de la investigación computacional reproducible . Chapman y Hall / CRC. ISBN 978-1466561595, http://www.crcpress.com/product/isbn/9781466561595 .

Wickham H (2009). ggplot2: Gráficos elegantes para el análisis de datos . Springer-Verlag Nueva York. ISBN 978-0-387-98140-6, http://ggplot2.org .

Wickham H y Francois R (2016). dplyr: una gramática de manipulación de datos . Paquete R versión 0.5.0, https://CRAN.R-project.org/package=dplyr .

Wickham H, Hester J y Francois R (2016). readr: Leer datos tabulares . Paquete R versión 1.0.0, https://CRAN.R-project.org/package=readr .

Answer 3

El revisor está equivocado:

 citation("stats")

The ‘stats’ package is part of R.  To cite R in publications use:

  R Core Team (2013). R: A language and environment for statistical computing. R
  Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. ISBN 3-900051-07-0, URL
  http://www.R-project.org/.

A BibTeX entry for LaTeX users is

  @Manual{,
    title = {R: A Language and Environment for Statistical Computing},
    author = {{R Core Team}},
    organization = {R Foundation for Statistical Computing},
    address = {Vienna, Austria},
    year = {2013},
    note = {{ISBN} 3-900051-07-0},
    url = {http://www.R-project.org/},
  }

We have invested a lot of time and effort in creating R, please cite it when
using it for data analysis. See also ‘citation("pkgname")’ for citing R
packages.

Answer 4

En nuestro book reciente, mi coautor y yo hicimos la cita (en el frente) pero también conseguimos que el editor nos deje dar crédito por paquete también:

Sentimos que era importante garantizar que aquellos que hicieron el trabajo recibieran crédito en todo momento.

(Habría hecho esto solo como un comentario, pero no puedo insertar fácilmente pix de esa manera y no quería alojar el img en alguna parte).