wickham - ¿Cómo lidiar efectivamente con los archivos guardados sin comprimir durante la verificación del paquete?

use packages in r

Question

En los esfuerzos recientes para desarrollar un paquete, estoy incluyendo conjuntos de datos en la carpeta de data/ de mi paquete. En mi caso específico tengo 5 conjuntos de datos, todos los cuales están en formato data.table (aunque los problemas que describo a continuación persisten si los mantengo como data.frame ). He guardado cada uno como archivos .rda individuales y los .rda documentado adecuadamente.

Cuando ejecuto check() desde el paquete de devtools , recibo las siguientes advertencias:

 checking data for ASCII and uncompressed saves ... WARNING
  Warning: large data file(s) saved inefficiently:
          size ASCII compress
  data1.rda 129Kb  TRUE     gzip
  data2.rda 101Kb  TRUE     gzip
  data3.rda 1.6Mb  TRUE     gzip

  Note: significantly better compression could be obtained
        by using R CMD build --resave-data
              old_size new_size compress
  data1.rda         129Kb     34Kb       xz
  data2.rda         101Kb     20Kb       xz
  data4.rda          92Kb     35Kb       xz
  data3.rda         1.6Mb    116Kb       xz
  species.rda     12Kb      9Kb       xz

He intentado guardar los datos con resaveRdaFiles ( tools paquete) con la compresión xz recomendada. Incluso después de hacer eso, la advertencia persiste.

OK, entonces ejecuto R CMD build --resave-data y la advertencia continúa persistiendo.

¿Qué me estoy perdiendo aquí y cómo puedo superar este problema (ahora y en el futuro)?

Answer 1

Cuando guarde su archivo .rda , use el comando: save(..., file=''test.rda'', compress=''xz'') Esto ayudará a resolver el problema!