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¿Cómo te conectas a un servidor remoto con ssh en R? (3)

Hay soporte directo para ssh / scp en RCurl:

x = scp("remote.ssh.host.com", "/home/dir/file.txt", "My.SCP.Passphrase", user="username")

¿Es posible conectarse al servidor ssh remoto con nombre de usuario y contraseña y leer un archivo? Investigué un poco y no encontré información sobre esto. Agradecería cualquier idea.


Es posible que esto no responda la pregunta inicial de @usuario1471980, pero si eres un usuario de mac y podrías correr

ssh -l user remotehost "cat /path/to/your/file"

en su caparazón como @sgibb sugirió pero obtuvo el error

ssh_askpass: exec(/usr/libexec/ssh-askpass): No such file or directory

cuando trataste de ejecutar la respuesta (read.table (pipe (''ssh ...''))) en R y no recibiste una solicitud de contraseña, probablemente no tengas el script ssh-askpass como sugiere el error y necesitas agregarlo /instalarlo.

Yo no sabía cómo hacerlo yo mismo, pero https://github.com/markcarver/mac-ssh-askpass lo resolvió por mí. Aquí está el guión. La página de github tiene instrucciones sobre cómo instalarlo.

#!/bin/bash # Script: ssh-askpass # Author: Mark Carver # Created: 2011-09-14 # Licensed under GPL 3.0 # A ssh-askpass command for Mac OS X # Based from author: Joseph Mocker, Sun Microsystems # http://blogs.oracle.com/mock/entry/and_now_chicken_of_the # To use this script: # Install this script running INSTALL as root # # If you plan on manually installing this script, please note that you will have # to set the following variable for SSH to recognize where the script is located: # export SSH_ASKPASS="/path/to/ssh-askpass" TITLE="${SSH_ASKPASS_TITLE:-SSH}"; TEXT="$(whoami)''s password:"; IFS=$(printf "/n"); CODE=("on GetCurrentApp()"); CODE=(${CODE[*]} "tell application /"System Events/" to get short name of first process whose frontmost is true"); CODE=(${CODE[*]} "end GetCurrentApp"); CODE=(${CODE[*]} "tell application GetCurrentApp()"); CODE=(${CODE[*]} "activate"); CODE=(${CODE[*]} "display dialog /"${@:-$TEXT}/" default answer /"/" with title /"${TITLE}/" with icon caution with hidden answer"); CODE=(${CODE[*]} "text returned of result"); CODE=(${CODE[*]} "end tell"); SCRIPT="/usr/bin/osascript" for LINE in ${CODE[*]}; do SCRIPT="${SCRIPT} -e $(printf "%q" "${LINE}")"; done; eval "${SCRIPT}";


¿Qué tiene de malo la respuesta de @JamesThompson en Can R para leer desde un archivo a través de una conexión ssh? ? (el segundo ejemplo de código funciona con nombre de usuario y contraseña)

Pruebe lo siguiente:

> d <- read.table(pipe(''ssh -l user remotehost "cat /path/to/your/file"'')) user@remotehost''s password: # type password here

ssh tiene que ser instalado y en $PATH .