run - ¿Por qué(o cuándo) es Rscript(o más pequeño) mejor que R CMD BATCH?

run r script from command line windows

Question

Estoy automatizando algunos webscraping con R en cron y algunas veces uso R CMD BATCH y algunas veces uso Rscript .

Para decidir cuál usar, me enfoco principalmente si quiero el archivo .Rout o no.

Pero al leer las respuestas a algunas preguntas aquí en SO (como this o this ) parece que Rscript es preferible a R CMD BATCH .

Entonces mis preguntas son:

• Además del hecho de que la sintaxis es un poco diferente y R CMD BATCH guarda un archivo .Rout mientras que Rscript no, ¿cuáles son las principales diferencias entre los dos?

• ¿Cuándo debería preferir uno sobre otro? Más específicamente, en el trabajo cron mencionado anteriormente, ¿se prefiere uno de ellos?

• Todavía no he usado littler , ¿cómo es diferente de Rscript y R CMD BATCH ?

Answer 1

Por lo que entiendo:

R CMD LOTE:

• repetir las declaraciones de entrada
• no puede salir a stdout

Rscript:

• NO hace eco
• salida a stdout
• se puede utilizar en un solo liner (es decir, sin archivo de entrada)

más pequeño:

• todo lo que Rscript hace
• puede leer comandos desde stdin (útil para canalización)
• tiempo de arranque más rápido
• cargar el paquete de métodos

En la práctica, uso Rscript para ejecutar scripts, en línea de comandos o en crons.

Answer 2

R CMD BATCH es todo lo que teníamos hace años. Hace que i / o sea muy difícil y deja archivos atrás.

Las cosas mejoraron, primero con Littler y luego también con Rscript. Ambos se pueden usar para líneas ''shebang'' como

 #!/usr/bin/r

 #!/usr/bin/Rscript

y ambos se pueden usar con paquetes como getopt y optparse --- permitiéndole escribir scripts R adecuados que pueden actuar como comandos. Si tengo docenas de ellas, comenzando con simples como esta que puedo llamar como install.r pkga pkgb pkgc y que instalará las tres y sus dependencias) para mí desde la línea de comandos sin acaparar el prompt R:

#!/usr/bin/env r       
#
# a simple example to install one or more packages 

if (is.null(argv) | length(argv)<1) {
  cat("Usage: installr.r pkg1 [pkg2 pkg3 ...]/n")
  q()
}

## adjust as necessary, see help(''download.packages'') 
repos <- "http://cran.rstudio.com"

## this makes sense on Debian where no packages touch /usr/local 
lib.loc <- "/usr/local/lib/R/site-library"

install.packages(argv, lib.loc, repos)

Y al igual que Karl, tengo cronjobs llamando a scripts R similares.

Edit on 2015-11-04: A partir de la semana pasada, littler ahora también está en CRAN .