Rtools no se detecta desde RStudio

packages shiny

Question

Estoy usando las últimas R, RStudio y Rtools.

- He actualizado las variables de entorno. Ahora puedo llamar a gcc o R desde la línea de comando.

Mientras intentaba publicar una aplicación desde RStudio, aparece el siguiente error,

Preparando la implementación de la aplicación ... HECHO Cargando paquete para la aplicación: 64015 ... Error: * La aplicación depende del paquete "Rtools" pero no está instalada. Por favor resuelva antes de continuar. Ejecución detenida

- He intentado esto, en la consola,

> find_rtools(T)
Scanning path...
ls : D:/Rtools/bin/ls.exe 
gcc: D:/Rtools/GCC-46~1.3/bin/gcc.exe 
VERSION.txt
Rtools version 3.3.0.1959 
Version: 3.3 
[1] TRUE

Entonces, ¡Rtools parece estar básicamente allí!

- He comprobado las variables de entorno, están bien, ya que también mencioné que R y gcc pueden iniciarse desde la línea de comandos

Sin embargo, intenté instalar y verificar desde RStudio usando el paquete de instalación, dice:

> install.Rtools()
No need to install Rtools - You''ve got the relevant version of Rtools installed
> 

- Esto no es una posible duplicación de esto, Rtools no está siendo detectado por R He intentado todo esto. No funcionó.

Por favor sugiera una solución. Muchas gracias por tu tiempo.

Answer 1

A través de R CMD verifique que no busque gcc en el directorio de Rtools :

R usa una variable BINPREF para localizar ciertos ejecutables, incluidos los componentes de RTools.

BINPREF se puede configurar en varios lugares. En mi caso, se configuró en C:/Users/MYUSERNAME/Documents/.R/Makevars . Al eliminar el contenido de este archivo, se eliminó un enlace a una instalación anterior, y desde entonces eliminada, de RTools.

También vale la pena consultar el archivo $RPATH/etc/i386/Makeconf (cambie i386 por x64 si tiene una instalación de 64 bits), que se volverá a crear con cada nueva instalación de R. Observe la línea BINPREF ?= c:/Rtools/mingw_32/bin/ , que (a través del operador ?= ) Establecerá el valor de BINPREF si aún no está configurado, como estaba en el archivo Makevars mencionado anteriormente.

Una solución temporal es reemplazar BINPREF ?= Con BINPREF = , pero como el archivo Make conf se sobrescribe cuando se actualiza R, deberá recordar hacer esto cada vez. Es mejor editar o eliminar el archivo Make vars para un cambio permanente.

Answer 2

No tengo idea de por qué RStudio tiene este tipo de problemas de vez en cuando, pero aquí se describe una solución manual:

https://github.com/rwinlib/r-base/wiki/Testing-Packages-with-Experimental-R-Devel-Build-for-Windows

Básicamente, debe establecer dos variables de entorno en la ruta de instalación correcta de Rtools:

Sys.setenv(PATH = paste("C:/Rtools/bin", Sys.getenv("PATH"), sep=";"))
Sys.setenv(BINPREF = "C:/Rtools/mingw_$(WIN)/bin/")

Para evitar perder este cambio después de reiniciar RStudio, puede modificar las variables de entorno de Windows en su lugar o agregar las siguientes filas a su archivo .Renviron que se ejecuta en cada inicio de R.

Por cierto: la parte $(WIN) no es un error tipográfico, pero se requiere para que R pueda inyectar "32" o "64" dependiendo de la versión R que esté utilizando (32 o 64 bits).

Edición 1:: vea también este artículo de r-bloggers publicado recientemente: https://www.r-bloggers.com/quirks-about-running-rcpp-on-windows-through-rstudio/

Answer 3

Tenga en cuenta que hay nuevos tipos potenciales de problemas (desde R 3.3 en adelante), ya que R ( no RStudio, pero R ) agrega una variable BINPREF y modifica la variable Path por defecto , consulte el archivo Renviron.site para este último, en Windows típicamente por ejemplo, en C:/Program Files/R/R-3.4.3/etc :

PATH="C:/Rtools/bin;${PATH}" 

Esto podría entrar en conflicto fácilmente para las personas con una ruta personalizada y / o múltiples versiones de Rtools instaladas, por lo que he comentado esto con un # .

Para el problema BINPREF , consulte el archivo Makeconf , por ejemplo, en C:/Program Files/R/R-3.4.3/etc/x64 :

BINPREF ?= c:/Rtools/mingw_64/bin/

Luego modifiqué esto a c:/Rtools34/mingw_64/bin/ , que es donde instalé mi Rtools34 .
Puede hacer lo mismo para el archivo Makeconf bajo el arco de 32 bits. subdirectorio.