para - ¿Cómo convertir una matriz simétrica en objeto "dist"?

poligono en r

Question

Quiero usar hclust para agrupar datos. Pero no quiero usar "dist ()" para generar el objeto dist. Luego descubrí que no puedo pasar una matriz simétrica como matriz de distancia a hclust .

¿Cómo convertir una matriz simétrica en objeto "dist"?

Answer 1

¿Esto es lo que necesitas? dist(matrix(1:16, nrow=4))

Answer 2

Parece que ya tiene una matriz calculada y desea usarla en hclust. Como dijo @shadow, puedes usar as.dist(yourMatrix) para convertir al formato dist.

Dada una tabla simétrica de distancias:

> yourMatrix<-matrix(c(1,2,3,4,2,1,2,1,3,2,1,3,4,1,3,1), nrow=4)
     [,1] [,2] [,3] [,4]
[1,]    1    2    3    4
[2,]    2    1    2    1
[3,]    3    2    1    3
[4,]    4    1    3    1
>
>as.dist(yourMatrix)
  1 2 3
2 2    
3 3 2  
4 4 1 3

Asegúrese de que los valores en su matriz sean disimilitud o métricas de distancia en lugar de puntajes de similitud.