loadmat - Guardar y cargar el dict de Python con savemat produce un error

open matlab mat file in python

Question

Aquí hay un ejemplo mínimo del error que recibo. Si entendí la documentación correctamente, esto debería estar funcionando, pero parece que no lo hice.

a={}
a[''test1'']=1
a[''test2'']=2
a[''test3'']=3
import scipy.io as io
io.savemat(''temp'',{''a'':a})
b = io.loadmat(''temp'')
b[''a''].keys()
Traceback (most recent call last):
File "<input>", line 1, in <module>
AttributeError: ''numpy.ndarray'' object has no attribute ''keys''

Answer 1

Parece que está operando bajo la suposición de que scipy.io.savemat está destinado a ser capaz de guardar un diccionario estándar. No creo que ese sea el caso. El argumento de diccionario contiene los nombres de matrices numpy que se escriben en el archivo Matlab. Entonces puedes hacer algo como esto

import scipy.io as io
import numpy as np
y1=np.array([1,2,3,4])
y2=np.array([10,20,30,40])
y3=np.array([100,200,300,400])
a={}
a[''test1'']=y1
a[''test2'']=y2
a[''test3'']=y3
io.savemat(''temp'',a)
b = io.loadmat(''temp'')
print b[''test1'']
print b[''test2'']
print b[''test3'']

lo que da:

[[1]
[2]
[3]
[4]]
[[10]
[20]
[30]
[40]]
[[100]
[200]
[300]
[400]]

Answer 2

Parece que loadmat devuelve recarray en lugar de dict. Lo comprobé con Scipy 0.9.0. Equivalente de b[''a''].keys() será b[''a''].dtype.names .

Ejemplos:

In [12]: b[''a''].shape
Out[13]: (1, 1)
In [14]: b[''a''].dtype.names
Out[16]: (''test1'', ''test3'', ''test2'')
In [17]: b[''a''][''test1'']
Out[17]: array([[[[1]]]], dtype=object)