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Explique la advertencia de ggplot2: "Se eliminaron k filas que contienen valores faltantes"

Question

Recibo esta advertencia cuando intento generar un diagrama con ggplot .

Después de investigar en línea durante un tiempo, muchos sugirieron que mi base de datos contiene valores nulos o datos faltantes en general, lo cual no fue el caso.

En esta pregunta, la respuesta aceptada dice lo siguiente:

La advertencia significa que algunos elementos se eliminan porque caen fuera del rango especificado

Me preguntaba a qué se refiere exactamente este rango y cómo alguien puede aumentarlo manualmente para evitar todas las advertencias.

Answer 1

El comportamiento que está viendo se debe a cómo ggplot2 maneja los datos que están fuera de los rangos de eje del gráfico. Puede cambiar este comportamiento dependiendo de si usa scale_y_continuous (o, equivalentemente, ylim ) o coord_cartesian para establecer rangos de eje, como se explica a continuación.

library(ggplot2)

# All points are visible in the plot
ggplot(mtcars, aes(mpg, hp)) + 
  geom_point()

En el siguiente código, un punto con hp = 335 está fuera del rango y de la gráfica. Además, debido a que usamos scale_y_continuous para establecer el rango del eje y, este punto no se incluye en ninguna otra estadística o medida de resumen calculada por ggplot, como la línea de regresión lineal.

ggplot(mtcars, aes(mpg, hp)) + 
  geom_point() +
  scale_y_continuous(limits=c(0,300)) +  # Change this to limits=c(0,335) and the warning disappars
  geom_smooth(method="lm")

Warning messages:
1: Removed 1 rows containing missing values (stat_smooth). 
2: Removed 1 rows containing missing values (geom_point).

En el siguiente código, el punto con hp = 335 todavía está fuera del rango y de la gráfica, pero este punto se incluye en cualquier estadística o medida de resumen que calcula ggplot, como la línea de regresión lineal. Esto se debe a que usamos coord_cartesian para establecer el rango del eje y, y esta función no excluye los puntos que están fuera de los rangos de la trama cuando realiza otros cálculos en los datos.

Si compara esto y el gráfico anterior, puede ver que la línea de regresión lineal en el segundo gráfico tiene una pendiente ligeramente más pronunciada, porque el punto con hp = 335 se incluye al calcular la línea de regresión, aunque no sea visible en el gráfico .

ggplot(mtcars, aes(mpg, hp)) + 
  geom_point() +
  coord_cartesian(ylim=c(0,300)) +
  geom_smooth(method="lm")

Answer 2

Solo por el batido completando la respuesta dada por eipi10.

Estaba enfrentando el mismo problema, sin usar scale_y_continuous ni coord_cartesian .

El conflicto provenía del eje x, donde definí limits = c(1, 30) . Parece que tales límites no proporcionan suficiente espacio si quieres "esquivar" tus barras, por lo que R aún arroja el error

Se eliminaron 8 filas que contienen valores faltantes (geom_bar)

Ajustar los límites del eje x a los limits = c(0, 31) resolvió el problema.

En conclusión, incluso si no está poniendo límites a su eje y, verifique el comportamiento de su eje x para asegurarse de tener suficiente espacio