repetidos - eliminar filas duplicadas en r
Eliminar duplicados manteniendo la entrada con el mayor valor absoluto (7)
Digamos que tengo cuatro muestras: id = 1, 2, 3 y 4, con una o más mediciones en cada una de esas muestras:
> a <- data.frame(id=c(1,1,2,2,3,4), value=c(1,2,3,-4,-5,6))
> a
id value
1 1 1
2 1 2
3 2 3
4 2 -4
5 3 -5
6 4 6
Quiero eliminar los duplicados, manteniendo solo una entrada por ID, la que tenga el mayor valor absoluto de la columna "valor". Es decir, esto es lo que quiero:
> a[c(2,4,5,6), ]
id value
2 1 2
4 2 -4
5 3 -5
6 4 6
¿Cómo podría hacer esto en R?
Aquí hay un enfoque dplyr
library(dplyr)
a %>%
group_by(id) %>%
top_n(1, abs(value))
# A tibble: 4 x 2
# Groups: id [4]
# id value
# <dbl> <dbl>
#1 1 2
#2 2 -4
#3 3 -5
#4 4 6
Echa un vistazo a ?aggregate
:
aggregate(value~id,a,function(x) x[which.max(abs(x))])
Me gusta la respuesta de @DWin, pero me gustaría mostrar cómo esto también podría funcionar con los metadatos:
aa<-merge(aggregate(value~id,a,function(x) x[which.max(abs(x))]),a)
# Fails if the max value is duplicated for a single id without next line.
aa[!duplicated(aa),]
No pude evitarlo y creé una última respuesta:
do.call(rbind,lapply(split(a,a$id),function(x) x[which.max(abs(x$value)),]))
Otro enfoque (aunque el código puede parecer un poco engorroso) es usar ave()
:
a[which(abs(a$value) == ave(a$value, a$id,
FUN=function(x) max(abs(x)))), ]
# id value
# 2 1 2
# 4 2 -4
# 5 3 -5
# 6 4 6
Puedes hacer esto con dplyr de la siguiente manera:
library(dplyr)
a %>%
group_by(name) %>%
filter(n == max(n)) %>%
ungroup()
Un enfoque de data.table
podría estar en orden si su conjunto de datos es muy grande:
library(data.table)
aDT <- as.data.table(a)
setkey(aDT,"id")
aDT[J(unique(id)), list(value = value[which.max(abs(value))])]
O una alternativa no tan rápida, pero a la vez rápida:
library(data.table)
as.data.table(a)[, .SD[which.max(abs(value))], by=id]
Esta versión devuelve todas las columnas de a
, en caso de que haya más en el conjunto de datos real.
aa <- a[order(a$id, -abs(a$value) ), ] #sort by id and reverse of abs(value)
aa[ !duplicated(aa$id), ] # take the first row within each id
id value
2 1 2
4 2 -4
5 3 -5
6 4 6
library(plyr)
ddply(a, .(id), function(x) return(x[which(abs(x$value)==max(abs(x$value))),]))