the - r markdown tutorial pdf

R-Markdown que evita los mensajes de carga del paquete

Question

He estado usando Knitr a través de R-Studio, y creo que es bastante limpio. Aunque tengo un problema menor. Cuando origen un archivo en un R-Chunk, el resultado knitr incluye comentarios externos de la siguiente manera:

+ FALSE Loading required package: ggplot2
+ FALSE Loading required package: gridExtra
+ FALSE Loading required package: grid
+ FALSE Loading required package: VGAM
+ FALSE Loading required package: splines
+ FALSE Loading required package: stats4
+ FALSE Attaching package: ''VGAM''
+ FALSE The following object(s) are masked from ''package:stats4'':

Intenté establecer las opciones de R-chunk de varias maneras, pero todavía no parecía evitar el problema:

```{r echo=FALSE, cache=FALSE, results=FALSE, warning=FALSE, comment=FALSE, warning=FALSE} 
source("C:/Rscripts/source.R");

```

¿Hay alguna forma de comentar estos mensajes?

Answer 1

Esta es una vieja pregunta, pero aquí hay otra manera de hacerlo.

Puede modificar el código R en lugar de las opciones de fragmento, envolviendo la llamada de source en suppressPackageStartupMessages() , suppressMessages() y / o suppressWarnings() . P.ej:

```{r echo=FALSE}
suppressWarnings(suppressMessages(suppressPackageStartupMessages({
source("C:/Rscripts/source.R")
})
```

También puede poner esas funciones alrededor de las llamadas de su library() dentro del "source.R" .

Answer 2

Mi mejor solución en R Markdown fue crear un fragmento de código solo para cargar bibliotecas y excluir todo en el fragmento.

{r results=''asis'', echo=FALSE, include=FALSE,}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE, warning=FALSE)
#formating tables
library(xtable)

#data wrangling
library(dplyr)

#text processing
library(stringi)

Answer 3

Puede usar include=FALSE para excluir todo en un fragmento.

```{r include=FALSE, cache=FALSE}
source("C:/Rscripts/source.R")
```

Si solo quiere suprimir mensajes, use message=FALSE lugar.

Por cierto, consulte la documentación de las opciones de fragmentos para conocer sus posibles valores, por ejemplo, FALSE no es un valor posible para los results las opciones.

Answer 4

```{r results=''hide'', message=FALSE, warning=FALSE}
library(RJSONIO)
library(AnotherPackage)
```

ver Opciones de fragmentos en los documentos de Knitr