how - pequeños marcadores de trazado de dispersión en matplotlib son siempre negros

subplot python

Question

Intento usar matplotlib para hacer un diagrama de dispersión con puntos grises muy pequeños. Debido a la densidad del punto, los puntos deben ser pequeños. El problema es que los marcadores de la función scatter () parecen tener una línea y un relleno. Cuando los marcadores son pequeños, solo la línea es visible, no el relleno, y la línea no es del color correcto (siempre es negra).

Puedo obtener exactamente lo que quiero usando gnuplot: trazar ''nodos'' con puntos pt 0 lc rgb ''gris''

¿Cómo puedo hacer puntos grises muy pequeños usando matplotlib scatterplot ()?

Answer 1

En respuesta a la pregunta de zwol en el comentario, mi reputación no es lo suficientemente alta como para dejar comentarios, así que esto tendrá que hacer: en el caso de que tus colores provengan de un mapa de colores (es decir, provienen de una "secuencia de valores a mapear") puede usar color = como se demuestra en lo siguiente:

from matplotlib import pyplot

x = [1,5,8,9,5]
y = [4,2,4,7,9]
numSides = [2,3,1,1,5]

cmap = pyplot.cm.get_cmap("copper_r")

min, max = min(numSides), max(numSides)
for i in range(len(x)):
    if numSides[i] >= 2:
        cax = pyplot.scatter(x[i], y[i], marker = ''+'', s = 100, c = numSides[i], cmap = cmap)
        cax.set_clim(min, max)
    elif numSides[i] == 1:
        pyplot.scatter(x[i], y[i], marker = ''.'', s = 40, color = cmap(numSides[i]))

fig = pyplot.gcf()
fig.set_size_inches(8.4, 6)
fig.savefig(''figure_test.png'', dpi = 200)
pyplot.show()

Answer 2

La respuesta más simple a su pregunta es: use el parámetro color lugar del parámetro c para establecer el color del marcador completo.

Es fácil ver la diferencia cuando se comparan los resultados:

from matplotlib import pyplot as plt

plt.scatter([1,2,3], [3,1,2], c=''0.8'')  # marker not all gray

plt.scatter([1,2,3], [3,1,2], color=''0.8'')  # marker all gray

Detalles: para su caso de uso simple en el que solo desea que su marcador sea del mismo color gris, no debería preocuparse por detalles como el color de la cara o el color de borde, y si su marcador está definido como todos los bordes o algunos bordes y algunos llenan. En su lugar, solo use el parámetro de color y sepa que su marcador completo se configurará con el color único que especifique.

Answer 3

Si el marcador no tiene rostro (no se puede rellenar, p ''+'' Ej., ''+'' , ''x'' ), entonces el edgecolor debe configurarse en lugar de c , y lw no debe ser 0 :

scatter([1,2,3], [2,4,5], marker=''+'', edgecolor=''r'')

Lo siguiente no funcionará

scatter([1,2,3], [2,4,5], s=1,  marker=''+'', facecolor=''0.5'', lw = 0)

porque el borde / línea no se mostrará, por lo que no se mostrará nada.

Answer 4

scatter([1,2,3], [2,4,5], s=1, facecolor=''0.5'', lw = 0)

Esto establece el marcador en 1 (s = 1), el color de la cara en gris (color de la cara = ''0.5'') y el ancho de la línea en 0 (lw = 0).