sierra - R pesadilla: Yosemite, R, RStudio y Homebrew

r for mac mojave

Question

Utilizo una MacBook Pro 13 "Retina (finales de 2013) con OS X Yosemite 10.10.2. No le deseo esto a mi peor enemigo. Bueno, tal vez.

Pesadilla en orden cronológico:

1. Descargado R y RStudio de sitios oficiales.
2. Corrió ambas aplicaciones un par de veces, bien.
3. Homebrew instalado. Corrió "brew doctor" en la terminal. El doctor Brew dijo que los archivos R eran problemáticos.
4. RStudio comenzó a actuar raro.
5. Descargado el paquete ggplot2 R a través del espejo CRAN. 5 GB de datos obstruyeron el archivo "private / var". Eliminado algunos datos allí.
6. Mac se asustó. El pánico del núcleo hasta que Apple Store Genius borró la Mac y reinstaló OS X.

Quiero seguir usando R y RStudio. Preguntas:

1. ¿Cómo puedo hacer esto sin volver a hacer saltar el Mac?
2. ¿Cómo instalar R y RStudio a través de Homebrew?
3. ¿Necesito instalar XQuartz primero?
4. ¿Qué pasaría si instalo R y RStudio desenfundado?
5. ¿Qué conflictos entre R, RStudio y Homebrew debo reconocer?
6. ¿Las peculiaridades comunes de tener todos Homebrew, R y RStudio instalados?
7. ¿Cómo puedo hacer que Homebrew, R y RStudio vivan felices para siempre sin quemar la casa?

¡Gracias!

Answer 1

¿Cómo puedo hacer esto sin volver a hacer saltar el Mac?

¡No intente eliminar su archivo de intercambio mientras la computadora está funcionando! Si comienzas a eliminar archivos de sistema aleatorios, vas a tener un mal día.

¿Cómo instalar R y RStudio a través de Homebrew?

Puedes instalar R con brew install r . Puede instalar un RStudio binario utilizando homebrew-cask, como brew install Caskroom/cask/rstudio .

¿Necesito instalar XQuartz primero?

No, esto ya no debería ser necesario.

¿Qué pasaría si instalo R y RStudio desenfundado?

Nada malo; brew doctor puede informar los hallazgos, pero estos no son errores y no debe asumir que representan problemas, aunque son útiles para los mantenedores como yo si busca ayuda para diagnosticar las fallas de compilación más adelante.

¿Qué conflictos entre R, RStudio y Homebrew debo reconocer?

No hay conflictos importantes. Si instala los compiladores desde http://r.research.att.com/libs/ , que no son necesarios si está usando una R elaborada, es posible que luego tenga problemas para instalar cosas como gcc (que proporciona gfortran) de Homebrew.

¿Las peculiaridades comunes de tener todos Homebrew, R y RStudio instalados?

A partir de agosto de 2015, los comentarios a continuación ya no son necesarios; los paquetes ahora se instalan en / usr / local / lib / R / xy / site-library de forma predeterminada y deben sobrevivir a pequeñas actualizaciones de R.

Si está utilizando una R elaborada y desea que sus paquetes instalados sobrevivan a las actualizaciones menores de R, puede ejecutar mkdir -p ~/Library/R/3.2/library y luego R instalará los paquetes en esa ruta de forma predeterminada (colocando los paquetes en su directorio personal y no en la bodega).

¿Cómo puedo hacer que Homebrew, R y RStudio vivan felices para siempre sin quemar la casa?

¡Véase más arriba!

Answer 2

Mirando hacia atrás a este problema, considerando todos los comentarios y respuestas útiles, con respecto a la descarga de paquetes R en una Mac con R y Homebrew ya instalado:

Hágalo en la consola R dentro de la interfaz RStudio, simplemente escribiendo install.packages("name of the package")

Desde que comencé a descargar paquetes R directamente en RStudio, no tuve ningún problema. El sistema está muy contento.